До 2003 года главой республики являлся Председатель Государственного совета Республики Дагестан.

Председатель Государственного совета Республики Дагестан

•          Магомедали Магомедов — 13 мая 1991 — 20 февраля 2006.

Президент. В настоящее время главой республики является Президент, назначаемый Президентом Российской Федерации. Пост Президента был утверждён 10 июля 2003 года. Список президентов Дагестана:

•          Муху Алиев — 20 февраля 2006 года — 20 февраля 2010 года;

•          Магомедсалам Магомедов — с 20 февраля 2010 года.

20 февраля 2006 по представлению Президента РФ Владимира Путина первым президентом Республики Дагестан избран аварец Муху Гимбатович Алиев, с 1991 возглавлявший республиканский парламент. На посту спикера его сменил сын Магомедали Магомедова Магомедсалам Магомедов, чью кандидатуру единогласно утвердил парламент. Одновременно с избранием Муху Алиева на пост президента республики был распущен Госсовет. В 2007 году председателем Народного собрания Республики Дагестан стал Сулейманов Магомед Валибагандович, срок полномочий которого истекает в марте 2011 года.

8 февраля 2010 — Президент РФ Дмитрий Медведев внёс на рассмотрение Народного Собрания Дагестана кандидатуру Магомедсалама Магомедова для наделения его полномочиями Президента республики.

Исполнительная власть

Высшим органом исполнительной власти до февраля 2006 являлся Государственный Совет, состоявший из представителей 14 народов Дагестана. Состав правительства утверждался Государственным советом, председатель правительства — Народным собранием Дагестана.

По негласному принципу национального паритета, высшие посты в Дагестане (председатель Госсовета, председатель парламента, председатель правительства) должны занимать представители различных национальностей.

Правительство Республики Дагестан:

1.         Осуществляет в пределах своих полномочий руководство органами исполнительной власти Республики Дагестан;

2.         Разрабатывает и реализует программы социально-экономического и национально-культурного развития Республики Дагестан;

3.         Разрабатывает и исполняет республиканский бюджет;

4.         Осуществляет меры по обеспечению комплексного социально-экономического развития Республики Дагестан, проведению единой государственной политики в области финансов, науки, образования, здравоохранения, социального обеспечения и охраны окружающей среды;

5.         Принимает в соответствии с законодательством меры по реализации, обеспечению и защите прав и свобод человека и гражданина, охране общественного порядка и борьбе с преступностью;

6.         Управляет и распоряжается собственностью Республики Дагестан, а также федеральной собственностью, переданной в управление Республики Дагестан;

7.         Заключает с федеральными органами исполнительной власти договоры о разграничении предметов ведения и полномочий, а также соглашения о взаимной передаче осуществления части своих полномочий;

8.         Осуществляет иные полномочия, предусмотренные Конституцией и законами Республики Дагестан, соглашениями с федеральными органами исполнительной власти, предусмотренными статьёй 78 Конституции Российской Федерации.